パッケージ: murasaki (1.68.6-13 など)

murasaki に関するリンク

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murasaki ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

類似のパッケージ:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

その他の murasaki 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64, x32 以外]

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

Boost.Iostreams ライブラリ

dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64, x32 以外]

Boost.Iostreams ライブラリ
dep: libboost-regex1.74.0-icu67 [sparc64]

パッケージは利用できません
dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [x32]

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.74.0
dep: libboost-system1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

Operating system (e.g. diagnostics support) library
dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4, sparc64 以外]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcrypto++6 [sparc64]

パッケージは利用できません
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [sparc64 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

rec: murasaki-examples

パッケージは利用できません

murasaki のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	586.0 kB	4,914.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.68.6-13+b5	611.1 kB	4,244.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.68.6-13+b5	533.9 kB	4,319.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.68.6-13+b5	444.2 kB	3,315.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.68.6-13+b5	457.2 kB	2,339.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	585.9 kB	4,020.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.68.6-13+b5	621.8 kB	4,071.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	658.9 kB	8,435.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	487.8 kB	3,599.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.68.6-13+b5	578.5 kB	5,874.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	597.0 kB	5,792.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.68.6-13+b4	599.9 kB	5,536.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.68.6-13+b3	572.8 kB	3,211.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.68.6-13+b4	596.5 kB	4,799.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.68.6-13+b4	505.8 kB	3,596.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.68.6-11	413.1 kB	3,088.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	481.2 kB	2,773.0 kB	[ファイル一覧]