パッケージ: meryl (0~20150903+r2013-8 など)

[ ソース: kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

その他の meryl 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• sug: gridengine-client

  Utilities for Grid Engine queue management

meryl のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	219.2 kB	1,770.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0~20150903+r2013-8+b3	192.7 kB	1,438.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0~20150903+r2013-8+b3	185.5 kB	1,571.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0~20150903+r2013-8+b3	195.5 kB	1,635.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0~20150903+r2013-8+b3	198.5 kB	1,379.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	282.7 kB	2,036.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0~20150903+r2013-8+b3	242.0 kB	1,919.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	268.4 kB	2,565.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	243.5 kB	1,955.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0~20150903+r2013-8+b3	210.1 kB	1,821.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	200.8 kB	1,834.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0~20150903+r2013-8+b3	208.3 kB	1,829.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64 (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	207.9 kB	1,258.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0~20150903+r2013-8+b3	175.0 kB	1,479.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	278.3 kB	1,891.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	178.9 kB	7,480.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0~20150903+r2013-8+b3	197.3 kB	1,435.0 kB	[ファイル一覧]