[ ソース: mecat2 ]
パッケージ: mecat2 (0.0+git20200428.f54c542+ds-4)
mecat2 に関するリンク
Debian の資源:
mecat2 ソースパッケージをダウンロード:
- [mecat2_0.0+git20200428.f54c542+ds-4.dsc]
- [mecat2_0.0+git20200428.f54c542+ds.orig.tar.xz]
- [mecat2_0.0+git20200428.f54c542+ds-4.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
ultra-fast and accurate de novo assembly tools for SMRT reads
An improved version of MECAT. It is an ultra-fast and accurate mapping and error correcting de novo assembly tools for single molecula sequencing (SMRT) reads. MECAT2 consists of the following three modules:
1. mecat2map: a fast and accurate alignment tool for SMRT reads. 2. mecat2cns: correct noisy reads based on their pairwise overlaps. 3. fsa: a string graph based assembly tool.
その他の mecat2 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム