パッケージ: lagan (2.0-10)

[ ソース: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

その他の lagan 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

lagan のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	178.8 kB	1,898.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	179.9 kB	834.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	170.4 kB	1,770.0 kB	[ファイル一覧]
armel	163.2 kB	691.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	162.4 kB	583.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	174.6 kB	716.0 kB	[ファイル一覧]
i386	186.7 kB	831.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	213.5 kB	1,035.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	155.6 kB	683.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	182.3 kB	1,924.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	190.5 kB	2,034.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	199.0 kB	1,898.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	180.8 kB	682.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	186.6 kB	802.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	179.3 kB	1,747.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	166.3 kB	23,868.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	174.9 kB	796.0 kB	[ファイル一覧]