[ ソース: fastani ]
パッケージ: fastani (1.33-3 など)
Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity
ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.
その他の fastani 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]
- GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: r-cran-genoplotr
- Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps
fastani のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 1.33-3 | 99.8 kB | 347.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 1.33-3 | 103.1 kB | 274.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 1.33-3 | 90.2 kB | 282.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 1.33-3 | 84.7 kB | 233.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 1.33-3 | 86.5 kB | 169.0 kB | [ファイル一覧] |
| hppa (非公式の移植版) | 1.33-3 | 99.3 kB | 255.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 1.33-3 | 115.5 kB | 293.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 1.33-3 | 135.9 kB | 551.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 1.33-3 | 97.7 kB | 265.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 1.33-3 | 101.0 kB | 356.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 1.33-3 | 105.9 kB | 346.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 1.33-3 | 106.9 kB | 346.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 1.33-3+b1 | 101.3 kB | 211.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 1.33-3 | 103.2 kB | 286.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 1.33-3 | 122.3 kB | 282.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 1.33-3 | 85.0 kB | 1,053.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 1.33-3 | 103.4 kB | 261.0 kB | [ファイル一覧] |