パッケージ: eigensoft (8.0.0+dfsg-2)

[ ソース: eigensoft  ]

reduction of population bias for genetic analyses

The EIGENSOFT package combines functionality from the group's population genetics methods (Patterson et al. 2006) and their EIGENSTRAT stratification method (Price et al. 2006). The EIGENSTRAT method uses principal components analysis to explicitly model ancestry differences between cases and controls along continuous axes of variation; the resulting correction is specific to a candidate marker's variation in frequency across ancestral populations, minimizing spurious associations while maximizing power to detect true associations. The EIGENSOFT package has a built-in plotting script and supports multiple file formats and quantitative phenotypes.

その他の eigensoft 関連パッケージ

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: liblapack3

  線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版

  または liblapack.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: liblapacke (>= 3.11.0) [ia64, s390x, sh4]

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

  dep: liblapacke (>= 3.12.0) [ia64, s390x, sh4 以外]

• dep: perl

  Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

eigensoft のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	480.8 kB	4,583.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	504.3 kB	3,869.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	463.9 kB	4,385.0 kB	[ファイル一覧]
armel	404.3 kB	3,564.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	392.1 kB	2,732.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	424.3 kB	3,598.0 kB	[ファイル一覧]
i386	493.9 kB	3,787.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	520.5 kB	7,400.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	411.2 kB	3,262.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	470.9 kB	4,607.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	517.4 kB	5,473.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	531.4 kB	5,409.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	503.1 kB	3,369.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	501.9 kB	4,541.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	438.5 kB	3,822.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	397.2 kB	11,898.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	504.6 kB	3,836.0 kB	[ファイル一覧]