[ ソース: insilicoseq ]
パッケージ: insilicoseq (2.0.1-1)
insilicoseq に関するリンク
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
sequencing simulator producing realistic Illumina reads
Primarily intended for simulating metagenomic samples, it can also be used to produce sequencing data from a single genome.
InSilicoSeq is written in Python, and use kernel density estimators to model the read quality of real sequencing data.
InSilicoSeq support substitution, insertion and deletion errors. If you don't have the use for insertion and deletion error a basic error model is provided.
その他の insilicoseq 関連パッケージ
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
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- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- dep: python3-requests
- 人間のために作られた、Python 3 向けの洗練された単純な HTTP ライブラリ
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- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3