パッケージ: python3-rdkit (202309.3-3 など)

python3-rdkit に関するリンク

Debian の資源:

rdkit ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.rdkit.org]

類似のパッケージ:

Collection of cheminformatics and machine-learning software

RDKit is a Python/C++ based cheminformatics and machine-learning software environment. Features Include:

 * Chemical reaction handling and transforms
 * Substructure searching with SMARTS
 * Canonical SMILES
 * Molecule-molecule alignment
 * Large number of molecular descriptors, including topological,
   compositional, EState, SlogP/SMR, VSA and Feature-map vectors
 * Fragmentation using RECAP rules
 * 2D coordinate generation and depiction, including constrained depiction
 * 3D coordinate generation using geometry embedding
 * UFF and MMFF94 forcefields
 * Chirality support, including calculation of (R/S) stereochemistry codes
 * 2D pharmacophore searching
 * Fingerprinting, including Daylight-like, atom pairs, topological
   torsions, Morgan algorithm and MACCS keys
 * Calculation of shape similarity
 * Multi-molecule maximum common substructure
 * Machine-learning via clustering and information theory algorithms
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats RDKit supports include MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES and RDKit binary format.

その他の python3-rdkit 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: fonts-freefont-ttf

Freefont Serif, Sans, Mono Truetype フォント
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

Boost.Iostreams ライブラリ
dep: libboost-python1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

Boost.Python Library
dep: libboost-python1.74.0-py39 [hppa]

パッケージは利用できません
dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa 以外]

Boost.Python Library
dep: libboost-python1.83.0-py311 [hppa 以外]

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-python1.83.0
dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.83.0
dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

serialization library for C++
dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa 以外]

serialization library for C++
dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

Operating system (e.g. diagnostics support) library
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, ppc64, s390x, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, hppa, m68k, ppc64, s390x, sparc64 以外]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10) [hppa 以外]

Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
dep: libcoordgen3 (>= 3.0.0) [hppa]

2D coordinate generation for chemical compounds

dep: libcoordgen3 (>= 3.0.2) [hppa 以外]
dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

FreeType 2 フォントエンジン共有ライブラリファイル
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libmaeparser1 (>= 1.2.4) [hppa]

parser for Schrödinger Maestro files

dep: libmaeparser1 (>= 1.3.1) [sparc64]
dep: libpython3.11 (>= 3.11.5) [alpha, ppc64]

Python 共有ランタイムライブラリ (バージョン 3.11)
dep: libpython3.11t64 (>= 3.11.5) [alpha, hppa, ppc64 以外]

Python 共有ランタイムライブラリ (バージョン 3.11)
dep: libpython3.9 (>= 3.9.1) [hppa]

パッケージは利用できません
dep: librdkit1 [hppa]

Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

dep: librdkit1 (>= 202309.3) [hppa 以外]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [hppa]
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

dep: python3 (<< 3.10) [hppa]

dep: python3 (<< 3.12) [hppa 以外]

dep: python3 (>= 3.11~) [hppa 以外]

dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [hppa]

Fast array facility to the Python language (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [alpha, ppc64]

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, hppa, ppc64 以外]
dep: python3-numpy-abi9

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
dep: rdkit-data

Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)

sug: rdkit-doc

Collection of cheminformatics and machine-learning software (documentation)

python3-rdkit のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	202309.3-2	4,303.8 kB	33,944.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	202309.3-3+b1	4,444.7 kB	30,900.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	202309.3-3+b1	4,192.6 kB	31,937.0 kB	[ファイル一覧]
armel	202309.3-3+b1	3,620.7 kB	22,612.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	202309.3-3+b1	3,713.5 kB	20,068.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	202009.5-2	3,843.8 kB	24,156.0 kB	[ファイル一覧]
i386	202309.3-3+b1	4,266.2 kB	24,926.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	202309.3-3	4,124.1 kB	24,065.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	202309.3-3+b1	3,831.3 kB	34,301.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	202309.3-2	4,292.4 kB	36,228.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	202309.3-3+b1	4,340.2 kB	34,820.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	202309.3-3+b1	4,441.5 kB	28,811.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	202309.3-3+b1	4,294.9 kB	30,430.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	202309.3-3	4,042.7 kB	65,911.0 kB	[ファイル一覧]