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パッケージ: python3-pairtools-examples (1.0.3-1 など)

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類似のパッケージ:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

その他の python3-pairtools-examples 関連パッケージ

  • 依存
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arm64 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
armel 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
armhf 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b2 12.1 kB50.0 kB [ファイル一覧]
i386 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b1 12.1 kB50.0 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b2 12.1 kB50.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版) 1.0.3-1+b1 790.3 kB844.0 kB [ファイル一覧]
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x32 (非公式の移植版) 0.3.0-3.2+b1 12.1 kB50.0 kB [ファイル一覧]