パッケージ: altree (1.3.2-2 など) [debports]
program to perform phylogeny-based association and localization analysis
ALTree was designed to perform association detection and localization of susceptibility sites using haplotype phylogenetic trees: first, it allows the detection of an association between a candidate gene and a disease, and second, it enables to make hypothesis about the susceptibility loci.
その他の altree 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libmath-tamuanova-perl
- Perl extension for the tamuanova library
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- dep: perl (>= 5.38.2-5)
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: perlapi-5.38.2t64
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: perl-base
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- rec: libopenblas0
- Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)
- または libblis4
- BLAS-like Library Instantiation Software Framework (32bit,meta)
- または libmkl-rt
- Intel® MKL: Single Dynamic Library (SDL)
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- sug: altree-examples
- example files for ALTree