パッケージ: ltrsift (1.0.2-10)

ltrsift に関するリンク

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ltrsift ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.zbh.uni-hamburg.de]

類似のパッケージ:

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, ユーザインタフェース: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, インタフェースツールキット: GTK, 目的: use::analysing, use::browsing, 比較, データの編成, use::viewing, x11::application

その他の ltrsift 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

GDK Pixbuf ライブラリ
dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

versatile genome analysis library
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)

C ルーチンの GLib ライブラリ
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

GTK graphical user interface library - old version
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

国際化されたテキストのレイアウトと描画

rec: last-align

genome-scale comparison of biological sequences
rec: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools

ltrsift のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	92.6 kB	468.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	96.6 kB	364.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	88.7 kB	464.0 kB	[ファイル一覧]
armel	87.6 kB	326.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	87.5 kB	278.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	91.3 kB	337.0 kB	[ファイル一覧]
i386	106.3 kB	410.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	109.0 kB	561.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	87.5 kB	334.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	83.3 kB	479.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	98.5 kB	528.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	98.0 kB	464.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	95.9 kB	316.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	90.7 kB	364.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	106.9 kB	400.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	97.8 kB	346.0 kB	[ファイル一覧]