パッケージ: libhts3 (1.19+ds-1)

[ ソース: htslib  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

タグ: 役割: 共有ライブラリ

その他の libhts3 関連パッケージ

• dep: libbz2-1.0

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ 形式の圧縮ライブラリ

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

libhts3 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	436.6 kB	1,080.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	402.3 kB	1,264.0 kB	[ファイル一覧]
armel	380.3 kB	967.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	385.0 kB	731.0 kB	[ファイル一覧]
i386	478.6 kB	1,191.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	392.1 kB	1,378.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	475.0 kB	1,523.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	448.1 kB	916.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	439.7 kB	1,156.0 kB	[ファイル一覧]