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[ ソース: libgkarrays  ]

パッケージ: libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4.2)

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library to query large collection of NGS sequences (development)

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

This is the development library for libgkarrays.

タグ: ソフトウェア開発: ライブラリ, 役割: 開発ライブラリ

その他の libgkarrays-dev 関連パッケージ

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アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
alpha (非公式の移植版) 92.8 kB611.0 kB [ファイル一覧]
amd64 83.2 kB515.0 kB [ファイル一覧]
arm64 80.5 kB509.0 kB [ファイル一覧]
armel 81.2 kB461.0 kB [ファイル一覧]
armhf 80.0 kB439.0 kB [ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版) 96.0 kB498.0 kB [ファイル一覧]
i386 90.7 kB495.0 kB [ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版) 100.7 kB607.0 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 85.5 kB478.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 89.6 kB563.0 kB [ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版) 86.3 kB538.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 87.1 kB531.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 160.8 kB1,390.0 kB [ファイル一覧]
s390x 79.4 kB510.0 kB [ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版) 85.0 kB443.0 kB [ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版) 77.9 kB514.0 kB [ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版) 82.4 kB468.0 kB [ファイル一覧]