パッケージ: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-9 など) [debports]
tree-ppuzzle に関するリンク
Debian の資源:
ソースパッケージをダウンロード:
見つかりませんメンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.tree-puzzle.de]
類似のパッケージ:
最尤法による系統樹の再構築 (並列化版)
TREE-PUZZLE (PUZZLE の新たな名前) は対話式のコンソールプログラムで、 巨大なデータセットを解析して、個々の内分枝の支持の推定を自動的に 割り当てる高速なツリー検索アルゴリズム quartet puzzling を実装しています。 TREE-PUZZLE はまた、ユーザが指定した系統樹に対して、その枝長だけで なく、ペアワイズ最尤距離も計算します。枝長は分子時計の仮定の下でも 計算することができます。さらに、TREE-PUZZLE は、仮定した内分枝の支持を ツリー全体を計算することなく調査し、配列アライメントの系統学的な 内容を視覚化する、尤度マッピングという新たな方法を提供します。
このパッケージは tree-puzzle の並列化バージョンです。
その他の tree-ppuzzle 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libsprng2
- SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package
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- dep: openmpi-bin
- high performance message passing library -- binaries
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- rec: tree-puzzle-doc
- Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)
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- sug: phylip
- package of programs for inferring phylogenies
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- sug: treetool
- パッケージは利用できません