パッケージ: avogadro (1.99.0-1 など) [debports]
分子可視化およびモデリングシステム
Avogadro は、分子および生体分子をターゲットとする分子グラフィックスおよ び分子モデリングシステムです。分子軌道や静電ポテンシャルなどの分子の物 性を可視化でき、直感的な分子ビルダーを備えています。
次のような機能があります:
* 力場に基づいた配座の自動最適化機能を備える分子モデリングツール * 拘束や配座異性体探索を含む分子力学法ツール * 分子軌道その他のな同値面の可視化 * 振動の可視化、振動スペクトルのプロット * 結晶単位格子の編集 * Gaussian, GAMESS および MOLPRO 量子化学パッケージ用の入力データの生成
* 拡張可能なプラグインアーキテクチャ、Python でのスクリプティング
Avogadro は、PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ファイルのほか、Gaussian, GAMESS, MOLPRO などの出力ファイルも読み込むことができます。
その他の avogadro 関連パッケージ
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- dep: libavogadro2-1t64 (>= 1.99.0)
- Molecular Graphics and Modelling System (library)
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1)
- Qt 5 コアモジュール
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- dep: libqt5gui5t64 (>= 5.7.0)
- Qt 5 GUI モジュール
- または libqt5gui5-gles (>= 5.7.0)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
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- dep: libqt5network5t64 (>= 5.0.2)
- Qt 5 ネットワークモジュール
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- dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.6.0~beta)
- Qt 5 ウィジェットモジュール
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- rec: avogadro-utils
- Molecular Graphics and Modelling System (library)
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- rec: molequeue
- Desktop integration of high performance computing resources