パッケージ: r-bioc-oligo (1.66.0+ds-1)

[ ソース: r-bioc-oligo  ]

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

その他の r-bioc-oligo 関連パッケージ

• dep: libblas3 [sparc64]

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, riscv64, sh4 以外]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  GNU Fortran アプリケーション用ランタイムライブラリ

• dep: liblapack3 [sparc64]

  線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版

  または liblapack.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

  Affymetrix File Parsing SDK

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

  BioConductor tools for parsing Affymetrix data files

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

  Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

  BioConductor collection of pre-processing functions

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  GNU R package providing a generic database interface

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-limma

  linear models for microarray data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

r-bioc-oligo のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	906.7 kB	1,355.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	907.7 kB	1,343.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	906.1 kB	1,355.0 kB	[ファイル一覧]
armel	906.3 kB	1,334.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	904.4 kB	1,322.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	907.4 kB	1,348.0 kB	[ファイル一覧]
i386	909.4 kB	1,346.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	910.9 kB	1,381.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	905.4 kB	1,358.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	910.3 kB	1,420.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	909.4 kB	1,355.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	907.2 kB	1,331.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	908.3 kB	1,343.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	907.4 kB	1,354.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	904.6 kB	2,317.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	907.2 kB	1,338.0 kB	[ファイル一覧]