[ ソース: libedlib ]
パッケージ: edlib-aligner (1.2.7-5)
edlib-aligner に関するリンク
Debian の資源:
libedlib ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
edlib sequence alignment tool using edit distance
Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.
Features of libedlib
* Calculates edit distance (Levehnstein distance). * It can find optimal alignment path (instructions how to transform first sequence into the second sequence). * It can find just the start and/or end locations of alignment path - can be useful when speed is more important than having exact alignment path. * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and infix(HW), each of them useful for different scenarios. * You can extend character equality definition, enabling you to e.g. have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to work with degenerate nucleotides. * It can easily handle small or very large sequences, even when finding alignment path, while consuming very little memory. * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.
その他の edlib-aligner 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libedlib1 (= 1.2.7-5)
- library for sequence alignment using edit distance
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
edlib-aligner のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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alpha (非公式の移植版) | 22.1 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
amd64 | 24.1 kB | 66.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 22.4 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 19.8 kB | 53.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 19.9 kB | 49.0 kB | [ファイル一覧] |
hppa (非公式の移植版) | 22.6 kB | 58.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 23.1 kB | 65.0 kB | [ファイル一覧] |
ia64 (非公式の移植版) | 27.5 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
m68k (非公式の移植版) | 22.7 kB | 61.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 22.9 kB | 87.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 24.9 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 27.5 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 | 22.4 kB | 54.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 26.5 kB | 74.0 kB | [ファイル一覧] |
sh4 (非公式の移植版) | 24.5 kB | 85.0 kB | [ファイル一覧] |
sparc64 (非公式の移植版) | 20.5 kB | 1,047.0 kB | [ファイル一覧] |
x32 (非公式の移植版) | 24.1 kB | 65.0 kB | [ファイル一覧] |