パッケージ: disulfinder (1.2.11-12 など)

disulfinder に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [disulfind.dsi.unifi.it]

類似のパッケージ:

cysteines disulfide bonding state and connectivity predictor

'disulfinder' is for predicting the disulfide bonding state of cysteines and their disulfide connectivity starting from sequence alone. Disulfide bridges play a major role in the stabilization of the folding process for several proteins. Prediction of disulfide bridges from sequence alone is therefore useful for the study of structural and functional properties of specific proteins. In addition, knowledge about the disulfide bonding state of cysteines may help the experimental structure determination process and may be useful in other genomic annotation tasks.

'disulfinder' predicts disulfide patterns in two computational stages: (1) the disulfide bonding state of each cysteine is predicted by a BRNN-SVM binary classifier; (2) cysteines that are known to participate in the formation of bridges are paired by a Recursive Neural Network to obtain a connectivity pattern.

タグ: 役割: プログラム

その他の disulfinder 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: disulfinder-data

data files for predictor of disulfide bonds in proteins
dep: libc6 (>= 2.33) [alpha, ia64, riscv64 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha, ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 11) [riscv64 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

disulfinder のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.2.11-12	223.7 kB	773.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.2.11-12	233.3 kB	676.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.2.11-12	200.7 kB	588.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.2.11-12	185.2 kB	567.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.2.11-12	190.6 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.2.11-12	214.0 kB	606.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.2.11-12	242.0 kB	707.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.2.11-12	296.9 kB	1,363.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.2.11-12	209.3 kB	619.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.2.11-12	203.5 kB	744.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.2.11-12	227.5 kB	828.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.2.11-12	236.6 kB	764.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.2.11-12+b1	226.4 kB	508.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.2.11-12	203.5 kB	676.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.2.11-12	262.2 kB	584.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.2.11-12	183.4 kB	609.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.2.11-12	232.1 kB	635.0 kB	[ファイル一覧]