パッケージ: autodock (4.2.6-9 など)

autodock に関するリンク

Debian の資源:

autodocksuite ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [autodock.scripps.edu]

類似のパッケージ:

タンパク質構造に結合するリガンドの分析ツール

AutoDock は、かなり小さいリガンド化学物質がかなり大きな受容体タンパク質へのドッキングする様子のシミュレーションを処理するプログラム群の代表パッケージです。以前のバージョンでは、配位子はすべての柔軟性を持っているのに対して、タンパク質は比較的剛直でした。この最新バージョン 4 は、表面残基の側鎖を選択して柔軟性を持たせることができます。すなわち、回転異性体を考慮に入れることができます。

AutoDock プログラムは、ターゲットタンパク質を記述するグリッド・セットへのリガンドの結合を処理します。このグリッドは AutoGrid により事前に計算されます。

タグ: 分野: 生物学, 構造生物学, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, works-with-format::TODO, 取り扱い対象: 3D モデル, 追加のタグが必要

その他の autodock 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, riscv64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

sug: autogrid

リガンドの受容体への結合を事前計算

autodock のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	4.2.6-9	176.2 kB	460.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	4.2.6-9	163.5 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.2.6-9	150.7 kB	375.0 kB	[ファイル一覧]
armel	4.2.6-9	156.7 kB	403.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	4.2.6-9	151.7 kB	315.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	4.2.6-9	169.2 kB	396.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.2.6-9	161.5 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	4.2.6-9	218.2 kB	788.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	4.2.6-9	157.0 kB	455.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	4.2.6-9	165.0 kB	460.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	4.2.6-9	164.6 kB	499.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.2.6-9	164.4 kB	435.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	4.2.6-9+b1	169.2 kB	373.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	4.2.6-9	149.3 kB	395.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	4.2.6-9	197.2 kB	388.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	4.2.6-9	162.7 kB	470.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	4.2.6-9	163.3 kB	399.0 kB	[ファイル一覧]