パッケージ: anfo (0.98-9)

[ ソース: anfo  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

その他の anfo 関連パッケージ

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, riscv64, sh4 以外]

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libelk0

  Scheme の実装 (Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  コマンドラインパラメータ解析用ライブラリ

• dep: libprotobuf17 [ia64]

  protocol buffers C++ library

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [ia64 以外]

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

anfo のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	113.7 kB	446.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	113.9 kB	439.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	105.0 kB	395.0 kB	[ファイル一覧]
armel	100.0 kB	345.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	101.9 kB	305.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	115.0 kB	387.0 kB	[ファイル一覧]
i386	119.5 kB	413.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	135.6 kB	620.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	113.7 kB	405.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	109.6 kB	438.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	115.0 kB	619.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	114.9 kB	619.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64 (非公式の移植版)	109.9 kB	361.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	104.1 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	125.5 kB	383.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	100.0 kB	418.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	113.9 kB	389.0 kB	[ファイル一覧]