パッケージ: kalign (1:3.4.0-1 など)

[ ソース: kalign  ]

グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

Kalign は、生物学的配列の多重アライメント実行用コマンドラインツールです。ア ライメントの正確さと速度の両方を改善するため、Muth-Manber の文字列照合アル ゴリズムを使用します。グローバルかつプログレッシブなアライメント手法を利用 しており、その上で、配列間距離の計算への近似文字列照合アルゴリズムの使用 と、ローカルのマッチを別のグローバルアライメントに組み込むことにより、機能 がさらに強化されています。

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の kalign 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

kalign のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1:3.4.0-1+b3	134.6 kB	1,127.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1:3.4.0-1+b4	88.1 kB	407.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77.6 kB	277.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1:3.4.0-1+b3	88.8 kB	341.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99.9 kB	471.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88.2 kB	287.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96.4 kB	371.0 kB	[ファイル一覧]