パッケージ: tabix (1.9-12~deb10u1)

[ ソース: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This version of tabix is built from the HTSlib source.

タグ: 実装言語: C, 役割: プログラム, 科学: science::calculation, use::calculating, サポート形式: HyperText Markup Language (HTML), 取り扱い対象: テキスト

その他の tabix 関連パッケージ

• dep: libbz2-1.0

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.15) [arm64 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (GnuTLS フレーバ)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ 形式の圧縮ライブラリ

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

tabix のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	284.8 kB	979.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	265.5 kB	883.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	256.2 kB	616.0 kB	[ファイル一覧]
i386	312.5 kB	1,072.0 kB	[ファイル一覧]