パッケージ: ltrsift (1.0.2-8)

[ ソース: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, ユーザインタフェース: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, インタフェースツールキット: GTK, 目的: use::analysing, use::browsing, 比較, データの編成, use::viewing, x11::application

その他の ltrsift 関連パッケージ

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

  ATK アクセシビリティツールキット

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

  汎用フォント設定ライブラリ - ランタイム

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  FreeType 2 フォントエンジン共有ライブラリファイル

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf ライブラリ

• dep: libgenometools0

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

  C ルーチンの GLib ライブラリ

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)

  GTK+ グラフィカルユーザインターフェースライブラリ

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  国際化されたテキストのレイアウトと描画

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  国際化されたテキストのレイアウトと描画

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

  国際化されたテキストのレイアウトと描画

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

ltrsift のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
i386	119.1 kB	447.0 kB	[ファイル一覧]