パッケージ: deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3)

[ ソース: deepnano  ]

MiniON ゲノム配列リード向け代替ベースコーラー

DeepNano は深層再帰型ニューラルネットに基く Oxford Nanopore MinION リード用の 代替ベースコーラーです。

現状、SQK-MAP-006 および SQK-MAP-005 chemistry で Metrichor のポストプロセッサ として動作します。

その他の deepnano 関連パッケージ

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: python

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)

• dep: python-dateutil

  powerful extensions to the standard Python datetime module

• dep: python-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)

• dep: python-numpy

  Numerical Python - Python 言語に高速な配列操作機能を追加

• dep: python-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python

• rec: python-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events - Python 2.x

deepnano のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
i386	20.5 kB	95.0 kB	[ファイル一覧]