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パッケージ: avogadro (1.2.0-4 など)

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分子可視化およびモデリングシステム

Avogadro は、分子および生体分子をターゲットとする分子グラフィックスおよ び分子モデリングシステムです。分子軌道や静電ポテンシャルなどの分子の物 性を可視化でき、直感的な分子ビルダーを備えています。

次のような機能があります:

 * 力場に基づいた配座の自動最適化機能を備える分子モデリングツール
 * 拘束や配座異性体探索を含む分子力学法ツール
 * 分子軌道その他のな同値面の可視化
 * 振動の可視化、振動スペクトルのプロット
 * 結晶単位格子の編集
 * Gaussian, GAMESS および MOLPRO 量子化学パッケージ用の
入力データの生成
 * 拡張可能なプラグインアーキテクチャ、Python でのスクリプティング

Avogadro は、PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ファイルのほか、Gaussian, GAMESS, MOLPRO などの出力ファイルも読み込むことができます。

タグ: 分野: 化学, ユーザインタフェース: Graphical User Interface, X ウィンドウシステム, 役割: role::program, uitoolkit::qt, 目的: データの可視化, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の avogadro 関連パッケージ

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  • 提案
  • enhances

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