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パッケージ: dialign-tx (1.0.2-12)

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セグメントベースの多重配列アライメント

DIALIGN-TX はタンパク質または DNA 配列のマルチプルアライメントを実行するた めのコマンドラインツールです。セグメントベースのアプローチの完全な再実装で あり、DIALIGN 2.2 や DIALIGN-T と比較して出力アライメントの品質を有意に向上 するいくつかの新たな改良や発見的手法を含んでいます。ペアワイズアライメント において、DIALIGN-TX は、低スコアの局所アライメントの連鎖を孤立した高スコア の断片より好む、断片連鎖アルゴリズムを使用します。マルチプルアライメントで は、偽の局所的な配列類似性に対する感度を落とすように改良された貪欲法を使用 します。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::TODO, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

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armel 64.7 kB171.0 kB [ファイル一覧]
armhf 60.7 kB123.0 kB [ファイル一覧]
i386 72.4 kB191.0 kB [ファイル一覧]
mips 78.5 kB194.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 90.2 kB231.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 79.9 kB194.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 89.0 kB212.0 kB [ファイル一覧]
s390x 65.2 kB183.0 kB [ファイル一覧]