[ ソース: abyss ]
パッケージ: abyss (2.1.5-7)
de novo, parallel, sequence assembler for short reads
ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.
その他の abyss 関連パッケージ
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- dep: bsdmainutils
- FreeBSD 由来のユーティリティ集
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libopenmpi3
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)
- SQLite 3 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: make
- コンパイルを制御するユーティリティ
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- dep: openmpi-bin
- high performance message passing library -- binaries
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- dep: openmpi-common
- high performance message passing library -- common files
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語