パッケージ: sigma-align (1.1.3-8)

[ ソース: sigma-align  ]

Simple greedy multiple alignment of non-coding DNA sequences

Sigma (“Simple greedy multiple alignment”) is an alignment program. It's algorithm and scoring scheme are designed specifically for non-coding DNA sequence.

It uses a strategy of seeking the best possible gapless local alignments. This happens at each step making the best possible alignment consistent with existing alignments. It scores the significance of the alignment based on the lengths of the aligned fragments and a background model. These may be supplied or estimated from an auxiliary file of intergenic DNA.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, use::comparing, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の sigma-align 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.12.0)

  C ルーチンの GLib ライブラリ

sigma-align のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	23.8 kB	62.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	22.9 kB	58.0 kB	[ファイル一覧]
armel	23.0 kB	57.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	21.1 kB	49.0 kB	[ファイル一覧]
i386	24.6 kB	61.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	24.2 kB	68.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	23.6 kB	63.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	26.8 kB	90.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	23.0 kB	62.0 kB	[ファイル一覧]