パッケージ: ncbi-blast+ (2.11.0+ds-1)

[ ソース: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 目的: use::analysing, works-with::biological-sequence

その他の ncbi-blast+ 関連パッケージ

• dep: libbz2-1.0

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database shared library

• dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls12 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libpcre3

  古い Perl 5 互換正規表現ライブラリ - ランタイムファイル

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

ncbi-blast+ のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	11,027.6 kB	48,457.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	9,952.6 kB	46,144.0 kB	[ファイル一覧]
armel	9,277.9 kB	39,361.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	9,512.3 kB	32,497.0 kB	[ファイル一覧]
i386	11,910.6 kB	47,640.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	8,183.2 kB	53,819.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	8,264.3 kB	52,934.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	11,161.4 kB	59,079.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	9,900.3 kB	48,543.0 kB	[ファイル一覧]