パッケージ: macs (2.2.7.1-3 など)

[ ソース: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

その他の macs 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29) [i386 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

macs のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.2.7.1-3+b2	2,457.8 kB	5,651.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.2.7.1-3+b2	2,297.1 kB	5,236.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.2.7.1-3+b2	2,301.4 kB	5,294.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.2.7.1-3+b2	2,340.8 kB	4,170.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.2.7.1-3+b2	2,450.1 kB	6,042.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.2.7.1-3+b2	2,386.1 kB	6,604.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.2.7.1-3+b2	2,249.0 kB	5,643.0 kB	[ファイル一覧]