[ ソース: kissplice ]
パッケージ: kissplice (2.5.3-3 など)
kissplice に関するリンク
Debian の資源:
kissplice ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [kissplice.prabi.fr]
類似のパッケージ:
Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data
KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.
その他の kissplice 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [amd64 以外]
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム