パッケージ: gromacs-mpich (2020.6-2)

[ ソース: gromacs  ]

Molecular dynamics sim, binaries for MPICH parallelization

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

This package contains only the core simulation engine with parallel support using the MPICH (v3) interface. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.

タグ: ソフトウェア開発: C での開発, ライブラリ, 分野: 生物学, field::chemistry, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::devel-lib, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, 取り扱い対象: パッケージ化されたソフトウェア

その他の gromacs-mpich 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)

  高速フーリエ変換計算ライブラリ - 倍精度

• dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)

  高速フーリエ変換計算ライブラリ - 単精度

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libhwloc15 (>= 2.4.1+dfsg)

  マシンの階層的ビュー - 共有ライブラリ

• dep: libmpich12 (>= 3.4.1) [amd64 以外]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 3.4.1-3) [amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 10.2) [armel]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [amd64, i386, ppc64el]

  dep: libstdc++6 (>= 6) [amd64, armel, i386, ppc64el 以外]

• dep: mpich

  Implementation of the MPI Message Passing Interface standard

• dep: neon-support [armhf]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: sse2-support [i386]

  prevent installation on processors without required instructions

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: gromacs

  構築と解析ツールを含む分子動力学シミュレータ

• sug: gromacs-data

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

gromacs-mpich のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	6,701.7 kB	18,083.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	5,289.5 kB	14,433.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3,426.3 kB	11,919.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3,221.0 kB	8,727.0 kB	[ファイル一覧]
i386	5,967.2 kB	18,363.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3,768.5 kB	14,581.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	3,908.2 kB	14,117.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4,390.0 kB	14,645.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3,277.8 kB	13,055.0 kB	[ファイル一覧]