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パッケージ: dextractor (1.0-4)

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(d)extractor and compression command library

Dextractor commands allow one to pull exactly and only the information needed for assembly and reconstruction from the source HDF5 files produced by the PacBio RS II sequencer, or from the source BAM files produced by the PacBio Sequel sequencer.

For each of the three extracted file types -- fasta, quiva, and arrow -- the library contains commands to compress the given file type, and to decompress it, which is a reversible process delivering the original uncompressed file. The compressed .fasta files, with the extension .dexta, consume 1/4 byte per base. The compressed .quiva files, with the extension .dexqv, consume 1.5 bytes per base on average, and the compressed .arrow files, with the extension .dexar, consume 1/4 byte per base

For more information, please view the available documentation at https://github.com/thegenemyers/DEXTRACTOR

その他の dextractor 関連パッケージ

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armhf 41.9 kB212.0 kB [ファイル一覧]
i386 46.2 kB332.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 41.3 kB290.0 kB [ファイル一覧]
mipsel 45.1 kB312.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 51.6 kB673.0 kB [ファイル一覧]
s390x 46.1 kB321.0 kB [ファイル一覧]