[ ソース: cufflinks ]
パッケージ: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-8 など) [non-free]
cufflinks に関するリンク
Debian の資源:
cufflinks ソースパッケージをダウンロード:
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-8.dsc]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1.orig.tar.gz]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-8.debian.tar.xz]
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Alexandre Mestiashvili (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Charles Plessy (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [cufflinks.cbcb.umd.edu]
類似のパッケージ:
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.
その他の cufflinks 関連パッケージ
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- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)
- serialization library for C++
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- dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64, armel, armhf]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.1) [s390x]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: gffread
- GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction
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- enh: tophat
- パッケージは利用できません
cufflinks のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,500.5 kB | 10,384.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,390.1 kB | 9,869.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,211.9 kB | 9,133.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,114.3 kB | 6,213.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,522.5 kB | 10,603.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,561.7 kB | 15,202.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,500.6 kB | 13,369.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,549.2 kB | 13,797.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 2.2.1+dfsg.1-8+b1 | 1,314.2 kB | 10,901.0 kB | [ファイル一覧] |