パッケージ: clustalw (2.1+lgpl-7)

[ ソース: clustalw  ]

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, ユーザインタフェース: テキストベースの対話, 役割: role::program, scope::utility, 目的: 比較, サポート形式: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

その他の clustalw 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• sug: clustalx

  Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

clustalw のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	275.1 kB	787.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	241.9 kB	710.0 kB	[ファイル一覧]
armel	240.2 kB	718.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	249.6 kB	542.0 kB	[ファイル一覧]
i386	294.8 kB	834.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	259.1 kB	941.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	258.4 kB	912.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	276.5 kB	918.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	247.5 kB	794.0 kB	[ファイル一覧]