パッケージ: python3-mappy (2.17+dfsg-12 など)

[ ソース: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

その他の python3-mappy 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

python3-mappy のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.17+dfsg-12+b3	127.2 kB	329.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.17+dfsg-12+b3	114.0 kB	309.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.17+dfsg-12+b3	130.6 kB	351.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.17+dfsg-12+b3	131.2 kB	259.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.17+dfsg-12+b3	158.7 kB	440.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.17+dfsg-12+b3	138.2 kB	392.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	2.17+dfsg-12+b3	151.7 kB	402.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.17+dfsg-12+b3	138.0 kB	433.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.17+dfsg-12+b3	135.7 kB	401.0 kB	[ファイル一覧]