[ ソース: fastqtl ]
パッケージ: fastqtl (2.184+dfsg-7 など)
fastqtl に関するリンク
Debian の資源:
fastqtl ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [fastqtl.sourceforge.net]
類似のパッケージ:
Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes
The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.
その他の fastqtl 関連パッケージ
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- dep: libblas3
- 基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ
- または libblas.so.3
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- Boost.Iostreams ライブラリ
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgsl25 (>= 2.6)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: r-mathlib
- GNU R - スタンドアローンな数学ライブラリ
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- sug: fastqtl-doc
- QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation