パッケージ: libvcflib1 (1.0.2+dfsg-2)

[ ソース: libvcflib  ]

C++ library for parsing and manipulating VCF files

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

タグ: 役割: 共有ライブラリ

その他の libvcflib1 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-5~) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf 以外]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

libvcflib1 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	148.4 kB	416.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	130.0 kB	376.0 kB	[ファイル一覧]
armel	133.1 kB	388.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	125.7 kB	272.0 kB	[ファイル一覧]
i386	150.7 kB	416.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	135.0 kB	449.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	138.7 kB	438.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	153.6 kB	532.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	133.5 kB	420.0 kB	[ファイル一覧]