パッケージ: libjellyfish-2.0-2 (2.3.0-10)
libjellyfish-2.0-2 に関するリンク
Debian の資源:
jellyfish ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Shaun Jackman (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Michael R. Crusoe (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [www.cbcb.umd.edu]
類似のパッケージ:
count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.
その他の libjellyfish-2.0-2 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.7) [amd64, arm64, ppc64el 以外]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf 以外]
libjellyfish-2.0-2 のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 63.6 kB | 198.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 59.5 kB | 189.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 55.5 kB | 165.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 55.9 kB | 137.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 70.1 kB | 197.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 60.6 kB | 226.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 69.0 kB | 286.0 kB | [ファイル一覧] |