パッケージ: r-cran-tcr (2.3.2+ds-1)

[ ソース: r-cran-tcr  ]

Advanced Data Analysis of Immune Receptor Repertoires

Cells of the immune system are the grand exception to the rule that all cells of an individuum have (mostly exact) copies of the same DNA. B cells (which produce antibodies) and T cells (which communicate with cells) however have a section of their DNA with genes of the groups V, D and J that are reorganised within the genomic DNA to provide the flexibility to deal with yet unknown pathogens.

This package provides a platform for the advanced analysis of T cell receptor repertoire data and its visualisations.

Caveat: This package is soon to be replaced by http://github.com/immunomind/immunarch which is not yet available as a Debian package.

その他の r-cran-tcr 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.0.1-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-data.table (>= 1.9.0)

  GNU R extension of Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 1.0.0)

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra (>= 0.9.0)

  GNU R package with extensions for the grid package

• dep: r-cran-gtable (>= 0.1.2)

  Arrange grobs in tables

• dep: r-cran-igraph (>= 0.7.1)

  GNU R network analysis and visualization

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.1)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.2.0)

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-scales (>= 0.3.0)

  Scale functions for visualization

• dep: r-cran-stringdist (>= 0.7.3)

  GNU R approximate string matching and string distance functions

• sug: r-cran-knitr (>= 1.8)

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.0)

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-roxygen2 (>= 3.0.0) [armel 以外]

  in-line documentation for GNU R

r-cran-tcr のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1,913.1 kB	2,114.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1,910.5 kB	2,106.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1,909.1 kB	2,101.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1,909.2 kB	2,081.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1,913.6 kB	2,113.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1,910.1 kB	2,127.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1,909.6 kB	2,116.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1,912.8 kB	2,150.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1,911.4 kB	2,118.0 kB	[ファイル一覧]