パッケージ: r-bioc-biocneighbors (1.8.2+ds-1)

[ ソース: r-bioc-biocneighbors  ]

Nearest Neighbor Detection for Bioconductor Packages

Implements exact and approximate methods for nearest neighbor detection, in a framework that allows them to be easily switched within Bioconductor packages or workflows. Exact searches can be performed using the k-means for k-nearest neighbors algorithm or with vantage point trees. Approximate searches can be performed using the Annoy or HNSW libraries. Searching on either Euclidean or Manhattan distances is supported. Parallelization is achieved for all methods by using BiocParallel. Functions are also provided to search for all neighbors within a given distance.

その他の r-bioc-biocneighbors 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpphnsw

  R bindings for a Library for Approximate Nearest Neighbors

• rec: r-cran-fnn

  GNU R fast nearest neighbor search algorithms and applications

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcppannoy

  Rcpp bindings for Annoy (approximate nearest neighbors)

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

r-bioc-biocneighbors のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	524.4 kB	1,142.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	499.9 kB	1,086.0 kB	[ファイル一覧]
armel	501.0 kB	1,056.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	501.3 kB	924.0 kB	[ファイル一覧]
i386	500.5 kB	1,142.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	489.0 kB	1,263.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	491.9 kB	1,223.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	520.2 kB	1,278.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	510.8 kB	1,174.0 kB	[ファイル一覧]