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[ ソース: golang-github-brentp-bix  ]

パッケージ: golang-github-brentp-bix-dev (0.0~git20190718.00aa7a7+ds-2)

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Tabix file access with golang using biogo machinery (library)

Bixis a pure go tabix reader. Tabix has a minimum resolution of 16K bases. So, for dense annotations like ExAC, repeated queries will have to re-parse the same intervals. To mitigate this, Bix caches all annotations for the blocks from each query and re-uses them for later queries to the same block. In practice, this results in 10X-100X speedup for any type of data.

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