[ ソース: circlator ]
パッケージ: circlator (1.5.6-5)
circlator に関するリンク
Debian の資源:
circlator ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [sanger-pathogens.github.io]
類似のパッケージ:
ゲノムアセンブリの環状化
Circlator は、バクテリアや小さな真核生物のゲノム用のアセンブリ環状化ツールで、 環状配列の正確な線形表現を生成できます。
その他の circlator 関連パッケージ
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- dep: bwa (>= 0.7.12)
- Burrows-Wheeler Aligner
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- dep: canu
- 一分子シークエンスゲノムアセンブラ
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- dep: fastaq (>= 3.12.1)
- FASTA and FASTQ file manipulation tools
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- dep: mummer
- 遺伝子全体の効率的な配列アライメント
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- dep: prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- dep: python3-openpyxl
- Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files
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- dep: python3-pymummer
- Python 3 interface to MUMmer
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- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- dep: spades
- genome assembler for single-cell and isolates data sets