パッケージ: clustalx (2.1+lgpl-9)

[ ソース: clustalx  ]

Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

This package offers a GUI interface for the Clustal multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, ユーザインタフェース: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, 対象範囲: ユーティリティ, インタフェースツールキット: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, 目的: 比較, use::viewing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の clustalx 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libqt5core5a (>= 5.7.0)

  Qt 5 コアモジュール

• dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI モジュール

  または libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2)

  Qt 5 ウィジェットモジュール

• dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2)

  Qt 5 XML モジュール

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• sug: boxshade

  多重配列アライメントのプリティプリンティング

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

clustalx のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
armel	369.2 kB	1,209.0 kB	[ファイル一覧]