パッケージ: python3-mappy (2.24+dfsg-3 など)

[ ソース: minimap2  ]

Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

その他の python3-mappy 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

python3-mappy のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.24+dfsg-3+b1	130.2 kB	330.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.24+dfsg-3+b1	127.2 kB	370.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.24+dfsg-3+b1	143.1 kB	380.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.24+dfsg-3+b1	144.0 kB	280.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.24+dfsg-3+b1	172.8 kB	485.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.24+dfsg-3+b1	155.2 kB	447.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	2.24+dfsg-3+b1	166.2 kB	440.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.24+dfsg-3+b1	150.4 kB	434.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.24+dfsg-3+b1	149.5 kB	434.0 kB	[ファイル一覧]