パッケージ: python3-htseq (1.99.2-1 など)

[ ソース: htseq  ]

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

This package contains the Python 3 module.

その他の python3-htseq 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

python3-htseq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.99.2-1+b3	261.3 kB	926.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.99.2-1+b3	236.1 kB	930.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.99.2-1+b3	233.8 kB	841.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.99.2-1+b3	235.2 kB	677.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.99.2-1+b3	261.7 kB	958.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.99.2-1+b3	218.5 kB	1,079.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1.99.2-1+b3	216.1 kB	993.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.99.2-1+b3	258.1 kB	1,122.0 kB	[ファイル一覧]