パッケージ: ipig (0.0.r5-4)

[ ソース: ipig  ]

integrating PSMs into genome browser visualisations

iPiG targets the integration of peptide spectrum matches (PSMs) from mass spectrometry (MS) peptide identifications into genomic visualisations provided by genome browser such as the UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG takes PSMs from the MS standard format mzIdentML (*.mzid) or in text format and provides results in genome track formats (BED and GFF3 files), which can be easily imported into genome browsers.

その他の ipig 関連パッケージ

• dep: libcommons-compress-java

  Java API for working with compression and archive formats

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libjdom1-java

  lightweight and fast library using XML

• dep: libxerces2-java

  DOM レベル 3 サポートおよび検証機能付き Java 用 XML パーサ

ipig のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
armel	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
i386	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	161.0 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	160.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]