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Package: garlic (1.6-1.1)

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programma per visualizzazione di biomolecole

Garlic è stato scritto per lo studio di proteine della membrana. Può essere usato per visualizzare altre proteine ed anche altri oggetti geometrici. Questa versione di garlic riconosce il formato PDB versione 2.1. Garlic può anche essere usato per analizzare sequenze proteiche.

Dipende solamente dalle librerie X, non sono necessarie altre librerie.

Le sue caratteristiche includono:

 - la posizione e lo spessore del piano di sezione sono visibili in una
   piccola finestra;
 - i legami atomici, così come gli atomi, sono trattati come oggetti
   disegnabili indipendentemente;
 - i colori degli atomi e dei legami dipendono dalla posizione: sono
   disponibili cinque modalità di mappatura (come per i piani);
 - possibilità di visualizzare immagini stereo;
 - possibilità di visualizzare altri oggetti geometrici, come la membrana;
 - le informazioni sugli atomi sono disponibili per l'atomo su cui è
   posizionato il puntatore del mouse: non è necessario fare clic,
   semplicemente muovere il mouse sopra la struttura!;
 - capacità di caricare più di una struttura;
 - capacità di disegnare grafici di Ramachandran, strutture delle
   alfa-eliche, diagrammi di Venn, grafici di idrofobicità media e di
   momento idrofobico;
 - il prompt dei comandi è disponibile alla base della finestra principale
   e può visualizzare un messaggio di errore e una stringa di comando.

Tags: Field: Biology, Chemistry, User Interface: X Window System, Role: role::program, scope::utility, Interface Toolkit: X library, Purpose: Data Visualization, X Window System: Application

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