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Il progetto BioRuby mira ad implementare con il linguaggio Ruby un ambiente integrato per la bioinformatica. La filosofia di progettazione della libreria BioRuby è KISS (Keep It Simple, Stupid; mantieni le cose semplici, stupido) per massimizzare l'usabilità e l'efficienza come strumento quotidiano per i biologi. Il progetto è nato in Giappone ed è supportato dalla Università di Tokyo (Human Genome Center), dalla Università di Kyoto (Bioinformatics Center) e dalla Open Bio Foundation.

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