Package: snp-sites (2.5.1-2 and others)

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codice binario per il pacchetto snp-sites

Questo programma trova siti di polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) da file di input di allineamenti multi-fasta (che possono essere compressi). Il suo output può essere in vari formati largamente usati (Multi Fasta Alignment, Vcf, phylip).

Il software è stato sviluppato al Wellcome Trust Sanger Institute.

Un polimorfismo a singolo nucleotide (SNP, pronunciato snip) è una variazione della sequenza di DNA che si verifica quando un singolo nucleotide, A, T, C o G, nel genoma (o un'altra sequenza condivisa) è differente nei membri di una specie biologica o in coppie di cromosomi. Per esempio, due frammenti di sequenze di DNA da individui diversi, AAGCCTA e AAGCTTA, contengono una differenza in un unico nucleotide. In questo caso ci sono due alleli. Quasi tutti i comuni SNP hanno due alleli.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

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dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libsnp-sites1 (>= 2.5.1)

librerie condivise del pacchetto snp-sites
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

libreria di compressione - runtime

Download snp-sites

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.5 kB	91.0 kB	[list of files]
amd64	2.5.1-2+b1	14.2 kB	39.0 kB	[list of files]
arm64	2.5.1-2+b1	14.3 kB	90.0 kB	[list of files]
armel	2.5.1-2+b1	14.1 kB	90.0 kB	[list of files]
armhf	2.5.1-2+b1	14.1 kB	90.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.4 kB	34.0 kB	[list of files]
i386	2.5.1-2+b1	14.2 kB	38.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.5.1-2	14.6 kB	35.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.0 kB	34.0 kB	[list of files]
mips64el	2.5.1-2+b1	14.4 kB	91.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.4 kB	155.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.5.1-2+b1	14.3 kB	155.0 kB	[list of files]
riscv64	2.5.1-2+b1	13.7 kB	34.0 kB	[list of files]
s390x	2.5.1-2+b1	14.1 kB	34.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.3 kB	90.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.4 kB	1,051.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.5.1-2+b1	14.1 kB	38.0 kB	[list of files]